双方达成合作后，黄金荣当即召集青帮核心弟子开会，下令全帮上下全力配合北洋政府清剿特务和贪腐残余。青帮弟子大多熟悉上海的大街小巷，又善于伪装，很快就展开了情报搜集工作。杜月笙亲自挑选了五十名精明能干的弟子，乔装成车夫、小贩、服务员，分布在租界各个角落，重点监视东瀛、约翰牛国、高卢鸡国特务的据点，以及西北逃匿贪腐官员的藏身之处。
三日后，青帮就搜集到了大量有价值的情报。杜月笙将情报整理成册，送到了王士珍手中：“聘卿先生，东瀛特务的主要据点在虹口废弃工厂，头目山口一郎每晚都会在工厂内召开会议；约翰牛国特务的据点在公共租界的维多利亚公寓三楼，哈里森平时住在公寓内，很少外出；高卢鸡国特务的据点在法租界的圣心教堂，皮埃尔每周三会在教堂内与手下接头。另外，我们还查到，东瀛特务近期正在策划一起爆炸案，目标是上海火车站，想要制造恐慌，而西北逃匿的前临洮县令就藏在法租界的一处民宅内，由青帮斧头帮的人看管。”
王士珍看着情报，脸色凝重：“必须尽快采取行动，不能让他们的阴谋得逞！郑镇守使，你立刻调派北洋军队，与青帮弟子配合，分四路同时行动：一路突袭虹口废弃工厂的东瀛特务据点，一路抓捕哈里森，一路围捕皮埃尔，最后一路解救前临洮县令并铲除斧头帮相关据点！行动时间定在明日凌晨三点，此时租界巡捕大多已经熟睡，戒备最为松懈。”
郑汝成立即领命，开始调兵遣将。王士珍则与黄金荣、杜月笙详细商议行动方案：第一路由王士珍亲自坐镇指挥，北洋宪兵两百人联合青帮弟子五十人，突袭虹口废弃工厂；第二路由郑汝成率领，北洋军队一百五十人联合青帮弟子三十人，突袭维多利亚公寓；第三路由张啸林率领，青帮弟子一百人联合北洋军队一百人，突袭圣心教堂；第四路由杜月笙率领，青帮弟子八十人联合北洋军队五十人，抓捕前临洮县令并清理斧头帮据点。为了避免引起列强干涉，行动时尽量使用短枪，避免大规模枪战，抓捕的目标暂时关押在镇守使署，待后续处理。
次日凌晨三点，行动准时开始。王士珍在指挥点通过青帮弟子的暗号实时掌握战况。第一路队伍趁着夜色直奔虹口废弃工厂，青帮弟子悄悄绕到工厂后方翻墙而入，解决了站岗的特务，打开大门让北洋军队冲了进去。工厂内灯火通明，东瀛特务们正在厂房内召开会议，山口一郎正拿着爆炸计划部署任务，突闻枪声顿时大乱，纷纷拿起武器抵抗。北洋宪兵训练有素，与青帮弟子协同作战，凭借地形优势逐步压缩特务活动空间，激战一个多小时后，东瀛特务被全部歼灭，山口一郎被当场击毙，共抓获俘虏十五人，缴获大量武器弹药和情报文件。
与此同时，第二路队伍顺利攻入维多利亚公寓三楼，约翰牛国特务毫无防备，大多被当场抓获，哈里森试图跳窗逃跑时被青帮弟子射伤腿部擒获；第三路队伍突袭圣心教堂，高卢鸡国特务依托神像抵抗，最终被前后夹击的北洋军队和青帮弟子制服，皮埃尔冒充神父试图蒙混过关，被识破后抓获；第四路队伍成功找到前临洮县令的藏身之处，将其抓获，同时铲除了斧头帮的三个据点，缴获大量贪腐赃款。
清剿行动大获成功，上海百姓拍手称快，各大报纸纷纷刊登此事，称赞北洋政府为民除害。然而，列强很快向北洋政府提出抗议，约翰牛国要求释放哈里森，东瀛更是威胁派遣军舰，高卢鸡国也紧随其后施压。
面对列强威胁，王士珍召开新闻发布会，公开列强特务的非法活动证据和前临洮县令的贪腐供词：“列强特务无视华夏法律，危害我国安全与人民利益；贪腐残余勾结黑帮，祸乱地方，清剿他们是正当合法之举！若是列强敢贸然动武，便是侵犯主权，北洋军队必将坚决反击！冯国璋将军与东南各省已表态支持中枢，吴将军在西北也已做好策应准备，华夏虽积弱，但绝不畏惧侵略！”
王士珍的强硬态度与确凿证据让列强投鼠忌器，最终放弃威胁，同意将特务移交华夏司法部门审判，前临洮县令则被押往西北，与其他贪腐官员一同受审。此后，王士珍与青帮建立长效防控网络，整顿上海治安，取缔非法场所，上海局势逐渐稳定。
就在上海清特工作步入正轨，王士珍准备向中枢上书汇报成果时，一封来自广东的加急密电骤然送到他手中。密电由北洋驻广东办事处长官紧急发报，字迹带着明显的慌乱：“广东突发重大刺杀案！中枢派驻广东协调军政的专员遭不明身份武装分子袭击，当场身亡！据现场痕迹与线人密报，刺客与上海漏网的特务残余、南方反动势力有勾结，且疑似获得东瀛暗中支持，广东局势已现动荡！”
王士珍捏紧发烫的密电，眉头瞬间紧锁。上海的特务清剿虽重创了敌人，但显然并未斩草除根，这些残余势力竟勾结南方反动力量，在广东悍然行刺北洋专员——这绝非孤立事件，而是针对北洋中枢、妄图搅乱南方局势的阴谋。