“汝修炼不易，奈何逆天行事。”玉帝叹道，将毒珠掷还。九头虫被自家毒焰所伤，现出原形——竟是共工怒触不周山时，溅出的一滴精血所化。玉帝取八景宫灯，将其封印于北冥之眼，永世不得出。
龙王感激涕零，献上定海神针铁。玉帝笑道：“此物合该另遇明主。”命龙王好生保管，日后自有缘法。
刚回凌霄殿，忽感心潮涌动。掐指一算，原是当年镇压魔祖罗睺时，其一丝残魂附在昊天剑上，潜入天宫。此刻正蛊惑执掌天条的青童君，欲篡改天道法则。
玉帝急赴天条殿，见青童君双目赤红，正在篡改姻缘簿。原来魔魂欲乱三界人伦，使人间夫妻反目，父子成仇，从根本上动摇天庭气运。
“道友迷了。”玉帝轻叹，头顶现出混沌珠，照定青童君元神。那魔魂尖啸欲逃，被玉帝一掌罩住。却不料魔魂竟自爆本源，污了三百条天条。玉帝不惜损耗本命元气，口吐真言，字字化成金色符篆，将破损天条逐一修补。
忽见一道天条崩裂，化作流光坠向凡间。玉帝分神追赶，见那流光投生在一书生之妻腹中。来年此子降生，取名包拯，日后将成为铁面无私的判官，补全人间法度——此乃后话。
修补天条毕，玉帝元气大伤，闭关九九八十一日。出关时忽见三界怨气升腾，原是人间帝王失德，战乱四起。玉帝欲降天罚，太白金星谏曰：“天道无为，人道自强。若事事干预，反失造化之机。”
玉帝颔首：“善。”乃命九天玄女降世，传授兵法韬略；遣文曲武曲下凡，辅佐明主；又让四海龙王节制雨水，使恶君之地旱涝交替。不过三年，民心归附有德之君，天下重归太平。
这日巡视天河，见织女坐望凡尘，面有忧色。问之，乃思凡间牛郎。玉帝感其真情，特准每年七月七日鹊桥相会。却不想开此先例，引得瑶池仙女皆动凡心。
王母忧心忡忡，玉帝笑曰：“天道无情亦有情。神仙若不知情为何物，又如何普度众生？只需设下考验，不使沉溺私情即可。”遂立情劫之规，欲成大道者，须经情关考验。
忽有巡天灵官急报：“北天门震动，似有异宝出世！”玉帝率众前往，见北天门裂开一隙，混沌之气涌入。原来是盘古开天时遗留的一处漏洞，此刻因星轨错乱即将崩裂。
玉帝不顾危险，只身踏入混沌。但见地水火风翻涌，仿佛重归鸿蒙。运大法力定住四方，却发现漏洞中心悬浮一物，竟是盘古大神的一节指骨。指骨感应到玉帝气息，忽然化作流光没入其眉心。
玉帝顿时明悟前因后果——自己原是盘古大神一丝执念所化，使命便是完善天地秩序。当下与指骨合一，道行圆满，周身放出无量光明，照彻三十六重天。挥手间补全漏洞，北天门恢复如初。
经此一事，玉帝神通更进一层，达到混元无极大罗金仙之境。却仍日日端坐凌霄殿，处理三界事务。这日批阅奏章至深夜，见烛火摇曳，忽然心有所感。
唤来司命星君，问：“朕执天条，可曾有失？”司命呈上善恶簿，玉帝亲自查阅。见一桩旧案：某年某地大旱，自己因与魔祖残魂争斗，迟了半刻行雨，致饿殍三千。
玉帝默然良久，脱冠解带，自囚于弥罗宫思过崖。三界仙神皆来劝解，玉帝道：“天子犯法，与庶民同罪。朕既疏失，岂能免责？”遂取打神鞭，自鞭三千。每鞭落下，皆有金光迸射，乃玉帝散修为补偿亡灵。
鞭毕，三界同悲。天道感其至公，降下玄黄功德，那些亡灵竟直接超脱轮回，化为三千护法天神。玉帝伤愈出关，见殿前多出三千金甲神人，皆跪拜曰：“愿永世护卫天庭。”
忽闻下界喧哗，原是东胜神洲有妖王聚会，欲反天庭。玉帝不怒反笑：“朕正欲完善天条，需集思广益。”竟降下法旨，请妖王赴蟠桃会。
群妖战战兢兢至南天门，却见玉帝撤去守卫，亲自相迎。宴间道：“天地本一体，何分仙妖？只要心存善念，皆可成道。”遂修订天条，增设妖仙司，准妖族修行正道者录入仙籍。
妖王感佩，尽数归顺。唯牛魔王倔强，玉帝也不强求，赐金丹一枚道：“且去修行，何时悟了，天门永开。”
自此三界宾服，万类和谐。玉帝仍日日临朝，事必躬亲。常对诸神言：“朕非统御三界，而是服务三界。天道无亲，唯与善人；帝心无私，只在众生。”
这一日，玉帝忽见人间汴梁城中红光冲天，推算是太祖赵匡胤黄袍加身。正要查看天命，忽感西方佛光炽盛，原来如来佛祖正开盂兰盆会。遂唤来太白金星：“朕欲微服私访，体察民情。”
化作游方僧人，行至华山脚下。见一老妇哭诉：女儿被山神强娶为妻。玉帝暗惊：“朕治下竟有此等事？”暗中查访，发现是假冒山神的熊精作祟。正欲出手，却见一书生仗剑而来，竟是华山三圣母之子沉香。
玉帝隐