六道仙人将查克拉的力量分给了众人，希望忍界的人们能借助查克拉的力量连接彼此，互相理解的同时避免战争的发生。后来六道仙人的长子因陀罗发明了结印，帮助人们引导查克拉与自身精神、身体能量结合，从而释放出各种忍术。如此，查克拉方才真正登陆了忍界的历史舞台。
总之，查克拉对忍界来说属于一种外来力量。是六道仙人将查克拉的种子分发给忍界的众人之后，忍界的人们才有了查克拉的力量。在大筒木一族降临忍界之前，这个世界的人们体内可能只有肉体和精神能量，是无法提取出查克拉的。所以在这之前，忍界主要的修行方式是自然能量。就比如大筒木一式附身的僧侣，就是自然能量的修行者
当然，以上这些只是春野樱依照漫画剧情所做出的推断。
说到底，还是鸣人的查克拉实在太多了，根本无法用课本上有关查克拉的定义解释。春野樱才会依照漫画剧情，推断出忍者的查克拉其实是由三种能量构成的。除了忍者的肉体和精神之外，还应该有来自六道仙人分发的查克拉种子。如此，便能解释为何在肉体与精神能量接近的情况下，不同忍者之间的查克拉量有如此巨大的差别。
而事实证明，春野樱的猜测是正确的。借由肉体、精神和自然三种能量，春野樱成功在精神世界中提炼出了特殊的查克拉。虽然这股查克拉比不上由四种能量所构成的仙人查克拉，但它却能帮助春野樱抚平体内因为咒印而不断涌现的自然能量。而伴随着自然能量渐渐被抚平，春野樱的精神世界也不再暴涨，她的身体也不用担心自然能量的侵蚀。
眼见春野樱居然当真通过肉体、精神和自然三种能量提炼出了特殊的查克拉，大蛇丸的分身眼中满是惊叹。毕竟春野樱用自己的实践证明，过去忍界流传了千年的查克拉理论是错误的。而春野樱自己构建的新理论，不仅得到了实践的证明，还能解释很多此前理论所无法解释的问题。回想起刚刚春野樱的话语，大蛇丸的分身下意识舔了舔舌头道：
“没有血统才是最强的天赋吗？春野樱，你这番话还真是惊人啊！”
就在大蛇丸的分身这般说的时候，春野樱的精神世界却是忽然抖动起来。感受着这股异变，大蛇丸的分身期待道：
“因为肉体、精神和自然三种能量都用来提炼新的查克拉，所以春野樱体内的未知能量开始暴动了！呵呵，很好，就让我看看这隐藏在所有忍者体内的未知能量，到底是何方神圣吧！”
大蛇丸的分身这般说罢，春野樱的精神世界中忽然生长出了一棵奇妙的大树。那棵树自然是查克拉种子所化，带有诡异的生命力。失去了控制的它在春野樱的精神世界中生根，发芽，然后不断吞噬着春野樱的肉体、精神和自然三种能量，并将之转化为自己生长的养料。
这查克拉种子的真面目吗？这根本就是一棵神树的幼苗啊！
感受着这棵树的力量，春野樱暗道：
果然，我的猜想是正确的。大筒木一族的力量来自于神树，就算是六道仙人也是如此。
也许六道仙人分发查克拉是出于好意，但他的做法从某种程度上，也是将神树的种子根植到忍界每个人的体内。
而大蛇丸的分身感受着查克拉种子那股贪婪的索取欲望，却是暗道：
原来如此！看来忍者修行仙人模式之所以会发狂，根本原因不是出在自然能量上，而是出在这未知的能量上。这种能量虽然能让忍者掌握了查克拉的力量，但看起来并不是什么好东西……呵呵，春野樱，我现在越来越觉得你的判断是正确的。
不过，面对如此暴怒又难缠的能量，你该如何应对呢？
就在大蛇丸的分身这般想的时候，她忽然发现那个大树的枝丫，忽然朝自己冲了过来。
“春野樱，你要做什么？”
看着满是不解的大蛇丸分身，春野樱轻笑道：
“老实说，大蛇丸，我还真没什么办法对付这种未知的能量，毕竟我也没掌握什么封印术。但是，作为与这股能量相处了十几年的主人，我对这股能量进行一些引导还是做得到的。”
“想不到，你居然用这股能量来对付我！”大蛇丸的分身冷笑道。
“没办法，谁让大蛇丸你的查克拉那么美味呢！”春野樱笑道：
“再者，既然天之咒印能够将你的灵魂封印在我的体内，那么封印住这股能量也是做得到的吧！”
春野樱这般说着，那棵由查克拉种子所演化的大树，枝丫已然缠绕在大蛇丸的灵魂分身上，开始不断吞噬她的灵魂。
感受着自己的存在正在逐渐消失，大蛇丸的分身也不见多少惊慌，而是继续冷笑道：
“不愧是你啊，春野樱，虽然我不止一次这么夸赞过你，但你的天赋还是超出了我的预料。这一局，是你赢了！不过没关系，我也不算输。即便我这具分身消失了