无论文武官员，都明白了辽东之战的最终目標，据此做出安排。
文官想著要抓紧时间重新掌权，枢密院的文职军官则想著：
要利用最后的时间多立功绩。
兵部左侍郎秦士文道：
“退出战时状態不仅要对官吏奖惩，对前线將士的赏赐，同样也应发下去。”
“以免战时状態结束后，朝廷许诺的奖励迟迟不至，让將士没有动力继续作战。”
这番话充满了对文官的不信任，引得许多官员怒目而视。
但是朱由检却知道这是很有可能的，点头道：
“这件事確实应注意。”
“无论对前线还是后方的奖惩，都应在战时状態结束前定下来。”
“兵部要抓紧时间准备，做好考功稽勛。”
又向枢密院一眾官员道：
“战爭之道，日新月异。”
“每一次大战之后，都要做好总结。”
“枢密院这次功劳很大，但是出现的问题也不少。”
“一定要查漏补缺，继续完善章程。”
袁可立等人应是，对这次枢密院的表现既有骄傲，又有一些羞愧。
骄傲的是枢密院成功发动了辽东之战，並且取得了胜利。
羞愧的是前线的战况完全不在预计內，枢密院对很多事情没有准备。
再加上后勤、生產等方面发现的问题，袁可立决定要趁著自己是战时宰辅，將枢密院的制度继续完善——
他作为枢密院的重新创立者，一定要对得起这个称呼、对得起皇帝的信任。
参谋部长杨嗣昌，此时更是羞愧。
因为被皇帝要求多制定预案的他，完全没有考虑过打到瀋阳怎么办。
就在上个月，参谋部还计划用今年水陆並进的成功方案，在明年疏通太子河进军辽阳，后年以同样的办法疏通浑河攻打瀋阳。
哪想到眨眼之间，辽阳就被各军合力攻下，现在他们就抵达瀋阳城外。
面对皇帝的期许，杨嗣昌郑重说道：
“臣一定会和参谋部诸君做好总结，下一次提出更完善的方案。”
朱由检点头讚许，叮嘱他道：
“不止是和参谋部的参谋总结，还要倾听前线的意见。”
“纵然他们对参谋工作可能不了解、会提出一些可笑的建议，参谋部同样要认真对待。”
“因为战爭就是他们打的，放在一个月前，谁能想到擅长守城的关寧军，竟然能攻到瀋阳城外？”
“战局瞬息万变，一定要让前线自主决断，准备好相应的支持。”
再一次强调给前线放权，朱由检又向杨嗣昌道：
“对参谋部的工作，朕有一个要求：那就是『相互独立，完全穷尽』。”
“参谋部要把战爭中的各项事务做好分类，所有参谋人员，对所负责的工作，都要提出方案。”
“在发现某种战事进展的可能性后，还可以独立提出预案，作为参考备选。”
“以后每次开战前，参谋部都要召开诸葛会，让所有人员自由討论，放飞想像、查漏补缺。”
这就是后世有名的ce分析法、头脑风暴法，核心是“相互独立，完全穷尽”。对重大议题做出分类，找到解决方法。
朱由检对此虽然只是泛泛而谈，却仍让杨嗣昌等人感觉醍醐灌顶，知道了应该如何改进。
在前线推行战场决策循环、在朝廷推行重大决策循环后，朱由检提出了更多理论，推动决策和管理的进一步完善。
尤其是对后勤部、装备部，朱由检在运输损耗之外，又提出运输效率、生產效率。对高出平均效率的人员进行奖励，对效率低下、甚至推委怠惰的人员进行惩戒。
两部官员惊得身上冒汗，觉得在当今皇帝手下，偷懒越来越难。
他们原本还想在奖惩时照顾一下亲近人员，如今看来却需要多注意一点。
——
对参谋、后勤、装备三部提出要求后，朱由检把目光转向边防部，让他们解决第二个问题：
“辽东收復之后，应当如何治理，边防部对此有什么意见？”
边防部长刘遵宪这段时间看著前面三部立功，早已急不可待。闻言当即取出一幅地图，悬在大殿上道：
“臣等思索辽东之失，发现第一个问题，在於辽东边墙修建。”
“陛下请看……”
指著地图上辽河套一带的边墙，刘遵宪道：
“辽河套地势平旷，没有山岭阻隔。”
“这一带沼泽密布，夏季水浅不及马腹，冬季结冰立成通途。”
“故而正统年间，提督辽东军务王翱