张广孝第二天发现峡谷内的拜占庭军逃走了，知道吴元济奇袭成功，就带领部队向峡谷内进发，发现里面已经空空如也，唐军顺利通过巴伊坎峡谷。
张广孝出了峡谷不久，就遇到吴元济派来接应的部队，就跟着赶到阿尼城。张广孝到达阿尼城之后，听说财物全被吴元济命人分掉了，心中有些不满，但是想到阿尼城是吴元济带人打下来的，也就不好说什么。
两军在阿尼城会师时，已经到了十月底，天气非常冷了，张广孝和吴元济认为既然已经完成作战任务，决定押着俘虏向南撤回。
由于两军都没带襄人团，最后吴元济留下三千镇东军守卫阿尼城，其他唐军全部撤退。两军到达边境小城吉兹雷后，吴元济决定率领镇东军，押着俘虏先退回大马士革，再回埃及，张广孝则率镇海军退往巴格达，先与李愬的部队汇合，而后再根据朝廷的旨意行事。
吴元济率军抵达大马士革之后，认为留在亚喀巴的那个羌戎团已经没什么意义，就派人将其调往阿尼城，将那里的镇东军替换回来，然后就率军带着俘虏回到埃及。
吴元济回到埃及时，副将郁景斌和一帮人已经在这里大干起来。
原来，吴元济出发不久，朝廷就派科工部少卿颜玮带着一帮造船专家和工人，乘船来到埃及，进驻开罗的两个造船厂。颜玮命人拉来不少机器，在苏伊士城卸载，而后经过苏开大道拉到开罗的造船厂。
两个造船厂经过颜玮等人的一番改造以后，具备了改装
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、新造战船的功能。颜玮决定，第一个造船厂专门改造大食的船只，主要就是将这些船加装蒸汽机和火炮，第二个造船厂全部新造战船，新的船只全部蒙上铁皮，战斗力和防御力更强一些。
郁景斌将搜罗到的大食战船全部拉到第一个造船厂，还帮助收集造船用的木料，运到第二个造船厂。至于需要的蒸汽机和火炮，只能从国内运到苏伊士城，然后再用大车沿着苏开大道运过来。
颜玮来了不久，农水部右侍郎訾臻韬也带人赶到了，他是专门负责修建苏伊士运河的。
訾臻韬带人查看了一番，觉得从坎塔拉（今埃及塞得港附近）到苏伊士附近，具备修建运河的条件，但是沿途缺水，必须要从尼罗河三角洲修一条水渠过来。
各军在大食境内先后经历几次大战，抓了不少俘虏，源源不断运到埃及。訾臻韬干脆留下护送俘虏的两个契胡团，让他们当监工，指挥十来万俘虏开挖运河和引水渠，风风火火就干了起来。
在开始第二波出征以后，李纯对部队取胜并不担心，重点考虑新征服的地区的人事配备问题。
六个出征的将领当中，李愬已经被授予瀚海路总督，严秦是一员老将，打完天竺以后，可以让他回来担任治安部尚书一职，张广孝、王之孝已经率部第二次出征，征战结束后，可以在天竺授予总督一职。
吴元济、宋朝隐资历较轻，又是第一次出征，穆庭路只有一半，吴元济可以暂代穆庭路总督一职，宋朝隐还要参加第三波征战才能升职。
这样一来，新组建的四个路，已经有三个为出征部队主将担任，还剩一个总督的位置。冀燕道按察使韦